Российско-Вьетнамский Тропический
научно-исследовательский и технологический центр
научно-исследовательский и технологический центр
Публикации
2013 г.
Водная экология
Two Species of Dorylaimids (Nematoda) from Waterbodies of Vietnam
V. G. Gagarin and V. A. GusakovAbstract: The new species Crocodorylaimus minor sp. n. is described, and Aporcella maitai (Yeates, 1967) comb. n. is redescribed. C. minor sp. n. resembles C. dadayi (Thorne et Schwanger, 1936), but differs from it in a shorter body, shorter odontostyle, absence of vulvar papillae, slenderer tail in females, and shorter spicules. Aporcelaimellus maitai Yeates, 1967 is transfered to the genus Aporcella Andrassy, 2002, taking the name Aporcella maitai (Yeates, 1967) comb. n. Aporcelaimellus heynsi Baqri et Jairajpuri, 1968 and Aporcelaimellus glandus Botha et Heyns 1991 are synonymized under Aporcella maitai (Yeates, 1967) comb. n. Identification keys to the valid species of the genera Crocodorylaimus and Aporcella are provided.
Keywords: Vietnam, fresh waterbodies, free-living nematodes, taxonomy, new species, Crocodorylaimus minor sp. n., Aporcella maitai (Yeates, 1967) comb. n.
INLAND WATER BIOLOGY, 2013, vol. 6, No. 3, pp. 176–183.
DOI: 10.1134/S199508291303005X
E-mail: gagarin@ibiw.yaroslavl.ru
Два новых вида семейства Actinolaimidae (Nematoda) из водоемов Вьетнама
В. Г. Гагарин, В. А. ГусаковЗООЛОГИЧЕСКИЙ ЖУРНАЛ, 2013, т. 92, № 3, с. 359–365
DOI: 10.7868/S0044513413010042
E-mail: gagarin@ibiw.yaroslavl.ru
Neotripyla vulgaris gen. n., sp. n. and Semitobrilus andrassyi sp. n. (Nematoda, Triplonchida) from freshwater bodies of Vietnam
Vladimir G. Gagarin & Vladimir A. GusakovAbstract : A new genus and two new species are described and illustrated from Vietnam. Neotripyla gen. n. has distinctive morpho-logical characters of both Tripylidae and Tobrilidae. The presence of three lips, a narrow stoma with no sclerotized walls, and the arrangement of outer labial and cephalic setae are characteristic of nematodes of the family Tripylidae. The pres-ence of vesiculate precloacal supplements in males and the absence of a muscular pouch for the spicular apparatus are characteristic of nematodes of the family Tobrilidae. Accordingly a new family, Neotripylidae fam. n., is established. Neotripyla vulgaris gen. n., sp. n. is designated the type and only species of the new genus and family. Semitobrilus an-drassyi sp. n. is closely related to S. gagarini (Ebsary, 1982), but differs in the longer spicules (71–80 μm vs 65 μm long in S. gagarini) and in the presence of keel-like projection and lateral ribs at distal part of spicules. S. gagarini (Ebsary, 1982) is considered a valid species of the genus Semitobrilus. A list of all valid species of the genus Semitobrilus and key for their determination are given.
Key words: descriptions, free-living freshwater nematodes, Neotripylidae fam. n., Neotripyla vulgaris gen. n., sp. n., Semitobrilus andrassyi sp. n., new family, new genus, new species, taxonomy, Vietnam
ZOOTAXA, 2013, № 4, pp. 565–576
E-mail: gagarin@ibiw.yaroslavl.ru; gva@ibiw.yaroslavl.ru
Описание двух видов свободноживущих нематод (Nematoda) из пресных водоемов Вьетнама
В. Г. Гагарин, В. А. ГусаковОписаны новый для науки вид нематод Monhystera longivaginata sp. n. и редкий Mononchulus nodicaudatus (Daday, 1901), обнаруженные в водоемах Вьетнама. Monhystera longivaginata sp. n. морфологически близка к M. paludicola de Man, 1881, но имеет более длинный и стройный хвост у самок, глазки располагаются ближе к переднему концу тела, имеется поствульварная железистая клетка и более длинная вагина. На основе проведенной ревизии рода Monhystera Bastian, 1865 ряд видов (M. lemani Juget, 1969, M. macramphus Filipjev, 1923, M. amabilis Gagarin, 1997, M. hamata Gagarin, Nguyen Vu Thanh, 2005 и M. melnikae Gagarin, Naumova, 2010) переведены в род Eumonhystera Andrбssy, 1981: E. lemani (Juget, 1969) comb. nov., E. macramphus (Filipjev, 1929) comb. nov., E. amabilis (Gagarin, 1997) comb. nov., E. hamata (Gagarin, Nguyen Vu Thanh, 2005) comb. nov. и E. melnikae (Gagarin, Naumova, 2010) comb. nov.
Ключевые слова: Вьетнам, пресные водоемы, свободноживущие нематоды, Monhystera longivaginata sp. n., Monоnchulus nodicaudatus (Daday, 1901), ревизия рода Monhystera.
БИОЛОГИЯ ВНУТРЕННИХ ВОД, 2013, № 4, с. 13–20
DOI: 10.7868/S0320965213040074
E-mail: gagarin@ibiw.yaroslavl.ru
Description of Two Species of Free-Living Nematodes (Nematoda) from Fresh Waterbodies of Vietnam
V. G. Gagarin and V. A. GusakovAbstract: The new nematode species Monhystera longivaginata sp. n. and the rare species Mononchulus nodicaudatus (Daday, 1901) collected in waterbodies of Vietnam are described. M. longivaginata sp. n. is morphologically similar to M. paludicola de Man, 1881, but differs from it in a longer and slenderer tail in females, ocelli situated closer to the anterior end of the body, the presence of a postvulval gland cell, and a longer vagina. The genus Monhystera Bastian, 1865 is revised, and several species of this genus (M. lemani Juget, 1969, M. macramphus Filipjev, 1923, M. amabilis Gagarin, 1997, M. hamata Gagarin et Nguyen Vu Thanh, 2005, and M. melnikae Gagarin et Naumova, 2010) are transferred to the genus Eumonhystera Andrassy, 1981 as E. lemani (Juget, 1969) comb. nov., E. macramphus (Filipjev, 1929) comb. nov., E. amabilis (Gagarin, 1997) comb. nov., E. hamata (Gagarin et Nguyen Vu Thanh, 2005) comb. nov., and E. melnikae (Gagarin et Naumova, 2010) comb. nov.
Keywords: Vietnam, fresh waterbodies, free-living nematodes, Monhystera longivaginata sp. n., Mononchulus nodicaudatus (Daday, 1901), revision of the genus Monhystera
INLAND WATER BIOLOGY, 2013, vol. 6, No. 4, pp. 268–275.
DOI: 10.1134/S199508291304007X
E-mail: gagarin@ibiw.yaroslavl.ru
Видовой состав ихтиофауны внутренних вод острова Фукуок, Сиамский залив, Вьетнам
Е. Д. Васильева, Д. А. Медведев, Чинь Тхи Лан Чи, Д. В. Праздников, Д. С. Павлов, Нгуен Тхи Нга, В. П. ВасильевВпервые проведены широкие исследования видового состава рыб внутренних водоёмов о-ва Фукуок, в результате которых идентифицированы 97 видов костистых рыб, представляющих 41 семейство 13 отрядов. С учётом предшествующих исследований составлен общий список ихтиофауны острова, включающий 99 видов, к этому числу можно добавить ещё один вид из недавней публикации по ихтиофауне острова, а также ещё 15–20 преимущественно эвригалинных видов, статус которых нуждается в уточнении. Только один вид из приведённого списка – нильская тиляпия Oreochromis niloticus – является интродуцентом; 14 видов никогда ранее не отмечались в фауне других регионов Вьетнама, большинство из них относятся к семейству Gobiidae. Два обнаруженных и описанных новых вида (в родах Rasbora и Barbucca), по-видимому, являются эндемичными. Ещё два вида из отряда сомообразных (Siluriformes), скорее всего, также должны быть описаны как новые виды.
Ключевые слова: видовой состав, ихтиофауна, о-в Фукуок, Вьетнам.
ВОПРОСЫ ИХТИОЛОГИИ, 2013, том 53, № 4, с. 405–422
DOI: 10.7868/S0042875213040097
E-mail: vas_katerina@mail.ru
Зоопланктон тропического мезотрофного водохранилища Кам Лам (центральный Вьетнам)
С. М. Жданова Исследованы видовой состав и структура сообщества зоопланктона мезотрофного водохранилища Кам Лам (Центральный Вьетнам) в 2008–2010 гг. По числу видов преобладали семейства коловраток Brachionidae, Lecanidae, Trichocercidae. Доминирующее положение по численности занимали веслоногие и ветвистоусые ракообразные, минимальные значения плотности и биомассы зоопланктона характерны для «сухого» периода (июль–сентябрь). Структура сообщества зоопланктона водохранилища типична и для других тропических водоемов.
Ключевые слова: Вьетнам, водохранилище, зоопланктон, численность, биомасса.
БИОРАЗНООБРАЗИЕ И ЭКОЛОГИЧЕСКИЕ ПРОБЛЕМЫ СОХРАНЕНИЯ ДИКОЙ ПРИРОДЫ. Сборник статей международной научной конференции молодых ученых посвященной 70-летию Национальной Академии Наук Армении, Цахкадзор, 3-5 мая 2013, с. 257–261
E-mail: zhdanova83@gmail.com
State of Gonads of Yearlings of Triploid Rainbow Trout Oncorhynchus mykiss Exposed to Androgenic Hormone under High-Mountain Conditions of South Vietnam
E. D. Pavlov, E. V. Ganzha, Nguen Viet Tui, and Nguen Ti Huan TuAbstract: Changes in the morphology of gonads under the effect of methyltestosterone in juveniles of triploid rainbow trout Oncorhynchus mykiss incubated and cultivated in a trout farm under climatic conditions of South Vietnam have been studied. It was shown that the effect of the androgenic hormone intensifies the formation and development of testes in triploid rainbow trout at an age of 1+, decreasing the proportion of sterile individuals and the proportion of fish with anatomical and cytological anomalies in the structure of gonads. The relationship between the found anomalies in the structure of the genital system of trout and its triploidization, hormonal effect, and abiotic environmental conditions is discussed.
Keywords: trout, Oncorhynchus mykiss, triploids, sex differentiation, histology, gonads, anomalies, South Vietnam
JOURNAL OF ICHTHYOLOGY, 2013, vol. 53, No. 9, pp. 739–752
DOI: 10.1134/S0032945213060088
E-mail: p-a-v@nxt.ru
Состояние половых желёз годовиков триплоидной радужной форели Oncorhynchus mykiss в высокогорных условиях южного Вьетнама при воздействии андрогенного гормона
Е. Д. Павлов, Е. В. Ганжа, Нгуен Вьет Туи, Нгуен Ти Хуан ТуИзучены изменения в морфологии гонад под воздействием метилтестостерона у молоди триплоидной форели Oncorhynchus mykiss, инкубированной и выращенной на форелевом хозяйстве в климатических условиях южного Вьетнама. Показано, что действие андрогенного гормона интенсифицирует формирование и развитие семенников у триплоидной радужной форели в возрасте 1+, снижая долю стерильных особей, а также долю рыб с анатомическими и цитологическими аномалиями в строении половых желёз. Обсуждается связь обнаруженных аномалий в строении половой системы форели с её триплоидизацией, гормональным воздействием и абиотическими условиями среды обитания.
Ключевые слова: форель, Oncorhynchus mykiss, триплоиды, дифференцировка пола, гистология, гонады, аномалии, южный Вьетнам.
ВОПРОСЫ ИХТИОЛОГИИ, 2013, том 53, № 6, с. 1–14
DOI: 10.7868/S0042875213060088
E-mail: p-a-v@nxt.ru
Electrical Activity of the Broadhead Catfish Clarias macrocephalus during Paired Aggressive–Defensive Interactions: Effects of Illumination and Chemical Alarm Signal
A. O. Kasumyan, V. M. Ol’shanskii, D. S. Pavlov, A. V. Podarin, Nguyen Thi Nga, and Vo Thi HaAbstract: We studied the effects of illumination and alarm pheromone on emition of specialized electric discharges in the broadhead catfish Clarias macrocephalus (Clariidae, Siluriformes) during aggressive–defensive interactions. The discharges were recorded with a special hardware in two adult fish of a similar size placed into an aquarium, during a period of 24 h, under alternating 30-min-long light (700 lx) and dark periods. The electrical activity of the broadhead catfish was found to be higher in the dark than under the light; by the end of the trial, the frequency of electrical discharges gradually decreased. The overall number of discharges recorded in different pairs of the fish was significantly different, which is evidence of individual variability in the electrical activity. Changes in the illumination regime in many cases increased the emition of electrical discharges, which could be a result of a stress-response. However, the stimulation of the fish by alarm pheromone (extract of the skin, 0.5 g/l) caused no pronounced changes in the electrical activity. It is supposed that aggressive motivation caused in the broadhead catfish by the presence of another individual of the same species dominated over the defensive response initiated by the alarm pheromone and, thus, dominated in the development of the electrical response.
Keywords: electrogeneration, specialized electrical discharges, electrical communication, aggressive–defensive behavior, individual variability, illumination, alarm pheromone, sensory deprivation, broadhead catfish.
JOURNAL OF ICHTHYOLOGY, 2013, vol. 53, No. 1, pp. 79–94.
DOI: 10.1134/S0032945213010062
E-mail: alex_kasumyan@mail.ru
Электрическая активность клариевого сома Clarias macrocephalus при парных агрессивно-оборонительных взаимодействиях: влияние освещённости и химического сигнала опасности
А. О. Касумян, В. М. Ольшанский, Д. С. Павлов, А. В. Подарин, Нгуен Тхи Нга, Во Тхи ХаИсследовали влияние освещённости и феромона тревоги на генерацию специализированных электрических разрядов клариевым сомом Clarias macrocephalus (Clariidae, Siluriformes) во время агрессивнооборонительных взаимодействий. Разряды регистрировали с помощью специальной аппаратуры у находящихся в аквариуме двух близких по размеру половозрелых рыб в течение 24 ч при чередовании 30-минутных световых (700 лк) и темновых периодов. Выяснено, что электрическая активность клариевых сомов в темноте выше, чем на свету; к концу опыта частота генерации электрических разрядов постепенно снижается. Суммарное число разрядов, регистрируемых у разных пар рыб, многократно отличается, что указывает на наличие у клариевых сомов индивидуальной вариабельности в проявлении электрической активности. Изменение светового режима во многих случаях вызывает усиление генерации электрических разрядов, что может быть проявлением стрессреакции. Однако стимуляция рыб раствором феромона тревоги (экстракт кожи, 0.5 г/л) не приводит к заметным сдвигам электрической активности. Предполагается, что агрессивная мотивация, вызванная у клариевых сомов присутствием особи своего вида, преобладает над оборонительной, развивающейся под действием феромона тревоги, и доминирует в формировании электрического ответа.
Ключевые слова: электрогенерация, специализированные электрические разряды, электрокоммуникация, агрессивно-оборонительное поведение, индивидуальная вариабельность, освещённость, феромон тревоги, сенсорная депривация, клариевые сомы.
ВОПРОСЫ ИХТИОЛОГИИ, 2013, том 53, № 1, с. 96–112
DOI: 10.7868/S0042875213010062
E-mail: alex_kasumyan@mail.ru
New water mite species (Acari, Hydrachnidia) from Vietnam
P. V. TuzovskijAbstract: Descriptions of four new water mite species, Torrenticola vietnamica sp. nov. (female), Limnesia vietnamensis sp. nov. (female, deutonymph), Hygrobates gusakovi sp. nov. (male), Albaxona gusevi sp. nov. (female) from running waters of Vietnam are presented.
Key words: water mites, Torrenticola vietnamica, Limnesia vietnamensis, Hygrobates gusakovi, Albaxona gusevi, running waters
ZOOTAXA, 2013, № 4, pp. 547–560
E-mail: tuz@ibiw.yaroslavl.ru
Медицина
Спектр антибиотикорезистентности клинических изолятов стрептококков групп С и G, патогенных для человека
Ю. Ю. Ильясов, Е. С. Лыгина, А. В. Дмитриев В представленной работе проведено исследование спектра резистентности к антимикробным препаратам коллекции стрептококков групп С и G, состоящей из 69 штаммов стрептококков: 58 штаммов Streptococcus dysgalactiae subspecies equisimilis и 11 штаммов Streptococcus anginosus. Определение чувствительности к антимикробным препаратам осуществлялось диско-диффузионным методом (МУК 4.12.1890-04) с использованием стандартизованных дисков (НИЦФ, Санкт-Петербург). Пенициллины сохраняли активность в отношении 100% штаммов коллекции. Чувствительными среди S. anginosus и S. dysgalactiae subsp. equisimilis к макролидам были от 5,8 до 26,1%, к препаратам тетрациклинового ряда - от 10,1 до 18,8% соответственно. Исследование показало, что бета-лактамные антибактериальные препараты и ванкомицин являются наиболее активными в отношении протестированных штаммов коллекции стрептококков групп С и G.
КЛИНИЧЕСКАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ И АНТИМИКРОБНАЯ ХИМИОТЕРАПИЯ, 2013, том 15, № 3, с. 235–238
E-mail:admitriev10@yandex.ru
Somatic changes in primary liver cancer in Russia: A pilot study
Olga Kalinina, Agnès Marchio, Aleksandr I. Urbanskii, Aleksandra B. Tarkova, Khadija Rebbani, Dmitri A. Granov, Anne Dejean, Mikhail I. Generalov, Pascal PineauAbstract: Primary liver cancer (PLC) is a major public health concern worldwide, ranking third among the causesof death from cancer. Molecular pathogenesis of PLC is known to be especially sensitive to ethno-environmental variations that modulate mutation spectra in tumours. Despite a high prevalence ofchronic liver diseases, the molecular epidemiology of PLC is still poorly known in Russia. To charac-terize the major genetic features of liver tumours in Russian populations, we conducted a pilot study on34 PLC cases (28 hepatocellular, two cholangiocellular, and four mixed cases) among patients attendingthe Radiology and Roentgenology Hospital in Saint Petersburg. Point mutations were searched in 9 genesthat are commonly altered in PLC, viz. TP53, CTNNB1, AXIN1, H/K/N-RAS, BRAF, PTEN, and NFE2L2. Thegenes TP53 and AXIN1 were mutated in 16% and 10% of the cases, respectively, whereas mutations of β-catenin were present in only 7% of samples, an unusual situation for Europe but common in East Asia.No R249S mutation indicative of exposure to aflatoxin B1 was detected in TP53. A single case harbouredan NFE2L2 mutation. The loss of chromosome 18q was associated with early onset of tumours (mean 50vs 62 yrs, p = 0.0252) and with the patient’s place of birth in Caucasus or Siberia. A lack of any risk factorwas noted in 47% of the patients, whereas only 23% of the patients were infected either by hepatitis virusB or C. An extension of the present cohort as well as further molecular studies are now warranted in orderto understand the processes governing liver carcinogenesis affecting Russian populations.
Keywords: Liver cancer, Oncogenes, Tumour suppressors, Chromosomes, Environment, Virusesa
MUTATION RESEARCH/GENETIC TOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL MUTAGENESIS, 2013
Предотвращение контактов с грызунами как способ снижения заболеваний населения зоонозными инфекциями (на примере чумы)
В. В. Сунцов, С. А. Шилова Эколого-физиологические и поведенческие особенности грызунов позволяют многим видам адаптироваться к жизни в непосредственной близости от человека и вступать с ним в тесный контакт, что создает серьезную опасность заражения зоонозами, в частности чумой. Дератизация как способ предотвращения заболеваний является важнейшим звеном неспецифической профилактики зоонозов. В России разработана новая концепция контроля численности хозяев и переносчиков возбудителя чумы, в которой важное место занимают способы снижения контактов человека с грызунами [8]. Новый подход к неспецифической профилактике чумы полностью соответствует современным международным требованиям к охране окружающей среды. Помимо ограниченного применения родентицидов рекомендована система санитарно-технических мер, обеспечивающих длительный дератизационный эффект. На примере Вьетнама показано, что благодаря преобразованию старых деревень в современные сельские населенные пункты и конструктивно-технической защите строений от грызунов ликвидирована заболеваемость чумой среди людей.
Ключевые слова: грызуны, зоонозные инфекции, заболеваемость населения, предотвращение контактов, природные очаги чумы, антропогенные очаги чумы.
ПЕСТ-МЕНЕДЖМЕНТ, 2013, № 2, с. 12–18
E-mail: vvsuntsov@rambler.ru
Генотипическая характеристика штаммов Mycobacterium avium subsp. hominissuis
Д. А. Старкова, Т. Ф. Оттен, И. В. Мокроусов, А. А. Вязовая, Б. И. Вишневский, О. В. НарвскаяНетуберкулезные микобактерии вида Mycobacterium avium – типичные обитатели окружающей среды, способные вызывать микобактериоз – инфекционное заболевание диких и домашних животных, птиц и человека. В настоящей работе представлены результаты первого молекулярно-генетического исследования российской популяции M. avium. Объектом изучения были 85 штаммов M. avium, выделенных от различных групп эпидемиологически не связанных пациентов в Cанкт Петербурге и Ленинградской области в 2008–2011 гг. Принадлежность штаммов к M. avium subsp. hominissuis была установлена на основе анализа инсерционных элементов IS901 и IS900 и полиморфизма фрагментов рестрикции гена hsp65. VNTR-типирование по восьми локусам (292, X3, 25, 47, 3, 7, 10 и 32 согласно международной схеме Thibault et al., 2007), впервые примененное для характеристики российской популяции M. avium, выявило генетическую неоднородность штаммов возбудителя микобактериоза человека. Шесть VNTR-типов с идентичными 8-значными числовыми профилями (число повторов в локусах) из 15 вариантов представлены кластерами, в состав которых входили 76 (89.4%) штаммов. Наиболее крупные кластеры с числовыми профилями 22221128 и 24221128 включали 45 (59.2%) и 15 штаммов (19.7%), соответственно; остальные кластеры содержали от двух до семи штаммов. Штаммы кластера 2533112'8 отличались от остальных “усеченным” локусом TR10 (аллель 2'). Учитывая, что заражение человека осуществляется от источников окружающей среды, высокий уровень кластеризации изученных штаммов M. avium при отсутствии связи между случаями заболевания можно объяснить невысокой вариабельностью (индекс разнообразия HGDI 0–0.61) восьми локусов VNTR.
ГЕНЕТИКА, 2013, том 49, № 9, с. 1048–1054
DOI: 10.7868/S0016675813090099
Документы
Буклет
Юбилейный буклет, посвященный 25-ти летию (1998 - 2013 гг.) Тропического центра. 
Наземная экология
A new species of Eoperipatus (Onichophora) from Vietnam reveals novel morphological characters for the South-East Asian Peripatidae
Ivo de Sena Oliveira, Stefan Schaffer, Pavel V. Kvartalnov, Eduard A. Galoyan, Igor V. Palko, Andreas Weck-Heimann, Peter Geissler, Hilke Ruhberg, Georg MayerAlthough representatives of Peripatidae are widely distributed in South-East Asia, only three valid species of Eoperipatus and one species of Typhloperipatus have been described from this region. According to previous reports, the three species of Eoperipatus show little morphological variation and are difficult to distinguish from each other. In this study, we describe a new species of Eoperipatus from Vietnam, E. totoro sp. nov., using morphological (light and scanning electron microscopy) and molecular data (mitochondrial COI and 12S rRNA sequences). A comparison with specimens of an undescribed species of Eoperipatus from Thailand revealed novel species-specific characters, including the characteristics of male crural complexes, distinct types of scales on the ventral body surface, the inner structure of the ircular pits on the male genital pad, and the position and size of the anal gland pads in males. The results of our molecular analyses correspond with those of morphological studies. In contrast to previous assumptions, our findings suggest a high diversity of the South-East Asian Peripatidae, which requires further exploration.
Keywords: Velvet worms, Morphological diversity, Distribution, Scanning electron microscopy, Taxonomy, Molecular phylogeny
ZOOLOGISCHER ANZEIGER, 2013, vol. 252, No. 4. P. 495–510
http://istina.msu.ru/media/publications/articles/7a8/671/2477912/Oliveira_et_al_2013_Eoperipatus_totoro_sp_nov.pdf
2012 г.
Наземная экология
Окно в тропики
П. В. Квартальнов ТРОИЦКИЙ ВАРИАНТ - НАУКА (ГАЗЕТА), 2012, № 20 (114), С. 8.
http://istina.msu.ru/media/publications/articles/84c/997/2477075/114N.pdf
Two new cryptic species of the Cyrtodactylus irregularis complex (Squamata: Gekkonidae) from southern Vietnam
Roman Nazarov, Nikolay A. Poyarkov, Nikolai l. Orlov, Trung My Phung, Tao Thien Nguyen, Duc Minh Hoang & Thomas ZieglerAbstract: We describe two new species of the Cyrtodactylus irregularis complex both based on phylogenetic analysis of 654 bp of COI mtDNA gene and morphological analyses of voucher specimens from Binh Phuoc and Lam Dong provinces, southern Vietnam. Cyrtodactylus bugiamapensis sp. nov. is described from the monsoon tropical forests of Bu Gia Map National Park, Binh Phuoc Province, and is distinguished from the remaining representatives of the C. irregularis complex by a combination of the following characters: (1) size medium, with a maximum SVL of 76.8 mm; (2) original tail relatively thin, longer than body; (3) presence of enlarged femoral scales without femoral pores; (4) preclocal groove lacking; (5) 36 46 longitudinal rows of ventral scales at midbody; (6) males with 7–11 precloacal pores in an angular continuous series; (7) absence of enlarged subcaudals; (8) dorsal pattern consisting of a dark neck band which can be medially divided, and irregular dark brown spots with bright white edges. Cyrtodactylus bidoupimontis sp. nov. is described from mountainous evergreen tropical forests of Bidoup – Nui Ba National Park, Lam Dong Province, and is most similar to C. irregularis sensu stricto from which it is distinguished by a combination of the following characters: (1) absence of enlarged, strongly keeled conical tubercles on the dorsal tail-base; (2) presence of flat rounded smooth to weakly keeled dorsal tubercles; (3) pallid dorsal head surface pattern lacking distinct dark brown irregular spots with light edges; and (4) elongated limbs. Phylogenetic analyses revealed the presence of a number of cryptic allopatric species within the C. irregularis complex. Long geological history and complicated relief of the Lang Bian plateau and surrounding areas might have shaped the present diversity within the C. irregularis complex. COI DNA-barcoding appears to be a useful tool to reveal cryptic diversity within the genus Cyrtodactylus.
Key words: Squamata, Gekkondidae, Cyrtodactylus bugiamapensis sp. nov., Cyrtodactylus bidoupimontis sp. nov., southern Vietnam, taxonomy
ZOOTAXA, 2012, pp. 1–24
Phaeoisaria vietnamensis sp. nov. and P. clematidis (hyphomycetes) from Vietnam
V. A. Mel’nik Abstract: A collection of a synnematous hyphomycete belonging in the genus Phaeoisaria was found on bark of a living unidentified liane in South Vietnam. It is described as a new species, Phaeoisaria vietnamensis, illustrated and compared with allied species. Furthermore, P. clematidis is recorded from two National Nature Parks in South Vietnam on different substrates.
Key words: anamorphic fungi, Ascomycota, new records, new taxon, Southeast Asia
MYCOSPHERE, 2012, vol. 3, part 6, pp. 957– 960.
vadim.melnik@mail.ru
A new species of Ardhachandra (hyphomycetes) from Vietnam
V. A. Mel’nik Abstract: A collection of a fungus belonging to the hyphomycete genus Ardhachandra was found on leaf litter of an unidentified broad-leaved tree in Vietnam and proved to be a new species, which is described as A. vietnamensis, illustrated and compared with allied species in the present paper.
Key words: Ascomycota, anamorphic fungi, new taxon, Southeast Asia
MYCOSPHERE, 2012, vol. 3, part 6, pp. 922–924
vadim.melnik@mail.ru
Анаморфные грибы. Вьетнама. II
В. А. Мельник, Ю. К. Новожилов, Е. С. Попов, А. В. Александрова МИКОЛОГИЯ И ФИТОПАТОЛОГИЯ, 2012, том 46, вып. 4, с. 247–256
vadim.melnik@mail.ru
Комплексы микроскопических грибов в почвах лесов разных географических регионов
А. В. Александрова, И. И. Сидорова БИОГЕОГРАФИЯ: МЕТОДОЛОГИЯ, РЕГИОНАЛЬНЫЙ И ИСТОРИЧЕСКИЙ АСПЕКТЫ: Материалы конференции, приуроченной к 80–летию со дня рождения Вадима Николаевича Тихомирова, 2012, с. 12–15
Распределение микромицетов в почвах горы Бидуп (Южный Вьетнам)
А. В. Александрова, К. А. Калашникова СОВРЕМЕННАЯ МИКОЛОГИЯ В РОССИИ, 2012, том 3. Тезисы 3–го Съезда микологов России, С. 140
Почвенные грибы равнинных и горных лесов Южного Вьетнама
К. А. Калашникова, А. В. Александрова СОВРЕМЕННАЯ МИКОЛОГИЯ В РОССИИ, 2012, том 3. Тезисы 3–го Съезда микологов России, С. 152
Разнообразие почвенных микроскопических грибов Южного Вьетнама
К. А. Калашникова, А. В. Александрова ТЕЗИСЫ ДОКЛАДОВ II(X) Международной ботанической конференции молодых ученых в Санкт–Петербурге, 2012, С. 27
Микроскопические грибы, участвующие в разложении опада равнинного полулистопадного тропического леса
К. А. Калашникова, А. В. Александрова ПРОБЛЕМЫ ЛЕСНОЙ ФИТОПАТОЛОГИИ И МИКОЛОГИИ, Материалы VIII Международной конференции "Проблемы лесной фитопатологии и микологии", 2012, с. 134–138
Исследования микобиоты Вьетнама. I. Род Entoloma: новые находки и новый вид
О. В. Морозова, Е. С. Попов, А. Е. Коваленко МИКОЛОГИЯ И ФИТОПАТОЛОГИЯ, 2012, том. 46, вып. 3. с. 182–200 (на английском)
Описание нового вида тараканов рода Prosoplecta Saussure, 1864 (Dictyoptera, Ectobiidae) из южного Вьетнама
Л. Н. АнисюткинЭНТОМОЛОГИЧЕСКОЕ ОБОЗРЕНИЕ, XCI, 2012, том 4, с. 742–756
Водная экология
Reproduction and spawning behavior of the climbing perch Anabas testudineus (Perciformes, Anabantidae) in an aquarium
D. D. ZworykinAbstract: Results of study of the spawning and reproductive behavior of the climbing perch Anabas testudineus in an aquarium are presented. Main specific features of reproduction of this species are revealed. In the performed experiments, climbing perches did not build a nest, did not prepare a spawning substrate, and did not show any forms of parental care. The pre-spawning and spawning behavior of the climbing perch is described, and fecundity and gonadosomatic index are determined. It is shown that intermittent spawning is typical of these fish. Mating system of the climbing perch is either polygamy or promiscuity. Sexual dimorphism in the climbing perch was not found. The eggs of the climbing perch have positive buoyancy and belong to the really pelagic type, which is rare for freshwater fish. Infanticide is a common phenomenon for the climbing perch. Breeding of the given species under aquarium conditions can be exercised without artificial hormonal stimulation, at different sex ratio, and under conditions of stocking density considerably exceeding standard aquacultural recommendations. The main specific features of reproduction of the climbing perch are discussed in relation to evolution of parental care in labyrinth fishes.
JOURNAL OF ICHTHYOLOGY, 2012, vol. 52, No 6, pp. 379–388
E-mail: d.zworykin@gmail.com
Размножение и репродуктивное поведение рыбы-ползуна Anabas testudineus (Perciformes, Anabantidae) в аквариуме
Д. Д. ЗворыкинПредставлены результаты исследования нереста и репродуктивного поведения рыбы-ползуна Anabas testudineus (анабаса) в аквариальных условиях. Выявлены основные особенности размножения данного вида. В проведённых экспериментах анабасы не строили гнездо, не готовили нерестовый субстрат и не проявляли никаких форм заботы о потомстве. Описано преднерестовое и нерестовое поведение анабаса, определены плодовитость и гонадосоматический индекс. Показано, что для этих рыб характерен порционный нерест. Брачные отношения анабаса представляют собой полигамию либо промискуитет. Признаков полового диморфизма у рыбы-ползуна не обнаружено. Икра анабаса имеет положительную плавучесть и относится к редкому для пресноводных рыб истинно пелагическому типу. Инфантицид является обычным для анабаса поведением. Размножение представителей данного вида в аквариальных условиях может осуществляться без искусственной гормональной стимуляции, при различном соотношении полов и в условиях плотности посадки, существенно превышающей общепринятые рыбоводные рекомендации. Основные особенности размножения анабаса обсуждены в контексте эволюции родительской заботы у лабиринтовых рыб.
ВОПРОСЫ ИХТИОЛОГИИ, 2012, том 52, № 4, с. 469–479
E-mail: d.zworykin@gmail.com
A new species of the genus Mallomonas (Synurophyceae), Mallomonas spinosa sp. nov., from Vietnam
E. S. GusevAbstract: Mallomonas spinosa sp. nov. is described from Vietnam. This species has domeless scales with unique four-edged spines, and which are ornamented with papillae. Mallomonas spinosa belongs to the section Papillosae. The morphological characteristics of the scales of the new species are documented by scanning electron micrographs and discussed in detail, including a comparison with related species in the genus Mallomonas.
PHYTOTAXA 66, 2012, pp. 1–5
E-mail: evsergus@yahoo.com
Alona kotovi sp. nov., a new species of Aloninae (Cladocera: Anomopoda: Chydoridae) from South Vietnam
A. Y. SinevAbstract: A new species of anomopod related to Alona quadrangularis (Cladocera: Anomopoda: Chydoridae) is described from streams in South Vietnam. Alona kotovi sp. nov. differs from the other species of Alona s. str. (the quadrangularis-group) by the morphology of its postabdomen, labrum and thoracic limbs. The presence of a short spine at the end of the male postabdominal claw is unique to the new species. A. kotovi sp. nov. is well-distinguished from two other Old World species, A. quadrangularis and A. kolwezii, yet shares numerous similarities with South American A. yara. This is one more case of connection between South American and Australasian faunas of Chydoridae.
Key words: cladocera, Alona kotovi sp. nov., morphology, South Vietnam
ZOOTAX 3475, 2012, рp. 45–54
E-mail: artemsinev@yandex.ru
New and rare Aloninae (Cladocera: Anomopoda: Chydoridae) from Indochina
A. Y. Sinev & A. A. KotovAbstract: Several poorly known cladocerans of the subfamily Aloninae (Cladocera: Anomopoda: Chydoridae) from Indochina region are reinvestigated. Revision of the genus Anthalona Van Damme, Sinev & Dumont 2011 from Thailand, Cambodia and Vietnam reveals that the region is inhabited by Paleotropic Alona harti harti Van Damme, Sinev & Dumont, 2011 and a new species, Alona sanoamuangae sp. nov., which appears to be an Indochinese endemic. It has a number of features primitive for the genus, including non-specialised IDL setae and non-differentiated scraping setae. So far, these characters were recorded only in the Congolese A. simplex Van Damme, Sinev & Dumont, 2011, but A. sanoamuangae sp. nov. differs from it in the trilobed cosmaria of the lateral head pores. An updated key for the Anthalona of Eurasia and Africa is provided. The endemic Alona freyi Idris & Fernando, 1981 belongs to the recently described genus Matralona Van Damme & Dumont, 2010, sharing numerous common features with the type species, Matralona simoneae (Dumont, 1981). Alona macronyx Daday, 1898, despite numerous unique features, should be moved from Alona to Celsinotum Frey, 1999, and the diagnosis of Celsinotum should be emended. Finally, a new taxon with several unique features, Coronatella sp., was found in Thailand. Our investigation demonstrates once more the necessity of successive revisions of cladoceran taxa, even in relatively well-studied regions.
Key words: Crustacea, Cladocera, Indochina, Oriental zone, Aloninae, Anthalona sanoamuangae, new species, morphology, systematics
Zootaxa 3334, 2012, pp. 1–28
E-mail: artem_sinev@mail.ru
E-mail: alexey-a-kotov@yandex.ru
Ихтиофауна водохранилищ центрального Вьетнама
И. А. СтолбуновВпервые изучен видовой состав, распределение и численность рыб в пелагиали и литорали четырех водохранилищ Центрального Вьетнама (Суои Чау, Кам Лам, Да Бан, Суои Зау). По данным исследований, ихтиофауна водоемов представлена 43 видами из 19 семейств рыб.
ВІСНИК ДНІПРОПЕТРОВСЬКОГО УНІВЕРСИТЕТУ. БІОЛОГІЯ. ЕКОЛОГІЯ, 2012, вип. 20, т. 1, с. 107–111.
E-mail: sia@ibiw.yaroslavl.ru
Медицина
Growth Phase-Dependent Modulation of Rgg Binding Specificity in Streptococcus pyogenes
Srivishnupriya Anbalagan, Alexander Dmitriev, W. Michael McShan, Paul M. Dunman and Michael S. ChausseeaStreptococcus pyogenes Rgg is a transcriptional regulator that interacts with the cofactor LacD.1 to control growth phase-dependent expression of genes, including speB, which encodes a secreted cysteine protease. LacD.1 is thought to interact with Rgg when glycolytic intermediates are abundant in a manner that prevents Rgg-mediated activation of speB expression via binding to the promoter region. When the intermediates diminish, LacD.1 dissociates from Rgg and binds to the speB promoter to activate expression. The purpose of this study was to determine if Rgg bound to chromatin during the exponential phase of growth and, if so, to identify the binding sites. Rgg bound to 62 chromosomal sites, as determined by chromatin immunoprecipitation coupled with DNA microarrays. Thirty-eight were within noncoding DNA, including sites upstream of the genes encoding them protein (M49), serum opacity factor (SOF), fibronectin-binding protein (SfbX49), and a prophage-encoded superantigen, SpeH. Each of these sites contained a promoter that was regulated by Rgg, as determined with transcriptional fusion assays. Purified Rgg also bound to the promoter regions of emm49, sof, and sfbX49 in vitro. Results obtained with a lacD.1 mutant showed that both LacD.1 and Rgg were necessary for the repression of emm49, sof, sfbX49, and speH expression. Overall, the results indicated that the DNA binding specificity of Rgg is responsive to environmental changes in a LacD.1-dependent manner and that Rgg and LacD.1 directly control virulence gene expression in the exponential phase of growth.
JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 2012, vol. 194, N 15, p. 3961–3971
Происхождение возбудителя чумы – микроба Yersinia pestis: структура видообразовательного процесса
В. В. СунцовПроисхождение и эволюция микроба чумы Yersinia pestis рассмотрены в контексте положений современного дарвинизма. Показано, что возбудитель чумы дивергировал от псевдотуберкулезного микроба Yersinia pseudotuberculosis O:1b в горностепных ландшафтах Центральной Азии в сартанское время, 22–15 тыс. лет назад. Видообразование прошло в паразитарной системе монгольский сурок-тарбаган (Marmota sibirica)–блоха Oropsylla silantiewi. В структуре видообразовательного процесса выделено шесть этапов: изоляция, генетический дрейф, нарастание внутрипопуляционного полиморфизма, начало синтеза пестицина (геномный конфликт и возникновение хиатуса), специализация (стабилизация признаков), адаптивная иррадиация (преобразование монотипического вида Y. pestis tarbagani в политипический вид). Сценарий открывает широкие перспективы для построения молекулярной филогении чумного микроба Y. pestis и изучения биохимических и молекулярно-генетических аспектов “дарвинской” эволюции возбудителей многих других природно-очаговых инфекционных болезней.
ИЗВЕСТИЯ РАН. СЕРИЯ БИОЛОГИЧЕСКАЯ, 2012, № 1, с. 5–13
E-mail: vvsuntsov@rambler.ru
Origin of the Plague Microbe Yersinia pestis: Structure of the Process of Speciation
V. V. SuntsovAbstract: The origin and evolution of the plague microbe Yersinia pestis are considered in the context of propositions of modern Darwinism. It was shown that the plague pathogen diverged from the pseudotuberculous microbe Yersinia pseudotuberculosis O:1b in the mountain steppe landscapes of Central Asia in the Sartan: 22000–15000 years ago. Speciation occurred in the tarbagan (Marmota sibirica)–flea (Oropsylla silantiewi) parasitic system. The structure of the speciation process included six stages: isolation, genetic drift, enhancement of intrapopulational polymorphism, the beginning of pesticin synthesis (genetic conflict and emergence of hiatus), specialization (stabilization of characteristics), and adaptive irradiation (transformation of the monotypic species Y. pestis tarbagani into a polytypic species). The scenario opens up wide prospects for construction of the molecular phylogeny of the plague microbe Y. pestis and for investigation of the biochemical and molecular–genetic aspects of “Darwinian” evolution of pathogens from many other nature-focal infections.
BIOLOGY BULLETIN, 2012, vol. 39, No. 1, pp. 1–9.
DOI: 10.1134/S1062359012010104
E-mail: vvsuntsov@rambler.ru
Геномный полиморфизм Streptococcus dysgalactiae subspecies equisimilis
Ю. Ю. Ильясов, А. В. ДмитриевStreptococcus dysgalactiae subspecies equisimilis является наиболее распространенным представителем стрептококков группы G и важным этиологическим агентом многих заболеваний человека. Несмотря на опубликование полногеномной последовательности S. dysgalactiae subsp. equisimilis, данные о генетической гетерогенности этого подвида практически отсутствуют в современной литературе. В настоящей работе проведен сравнительный анализ большой коллекции штаммов S. dysgalactiae subsp. equisimilis, выделенных в различных географических регионах. Проанализировано наличие генов вирулентности scpG, lmb, nga, speG и ska. Обнаружена выраженная гетерогенность гена scpG. Осуществлено emm-генотипирование ряда штаммов. Проведен анализ штаммов методом электрофореза в пульсирующем электрическом поле. В результате работы выявлен значительный геномный полиморфизм S. dysgalactiae subsp. equisimilis.
Ключевые слова: патогенные стрептококки, Streptococcus dysgalactiae subspecies equisimilis, электрофорез в пульсирующем электрическом поле, гены вирулентности, геномный полиморфизм.
МЕДИЦИНСКИЙ АКАДЕМИЧЕСКИЙ ЖУРНАЛ, 2012, том 12, № 2, с. 90–96
E-mail:kolpino@hotmail.com